私たちと私たちに住む微生物は私たち自身の細胞よりも多い。 人間の腸内の微生物叢は、自然界に知られている最も密集した細菌の生態系の1つです。 それは代謝機能および免疫応答を調節し、気分および行動に寄与する。 不均衡は、 炎症性腸疾患 （IBD）および代謝障害を含む様々な疾患に関連している。
一方、健康なマイクロビオムは 、以前はその有害作用のみで知られていたヘリコバクター・ピロリ（Helicobacter pylori）の場合に示されているように、保護機能を有することができる。
科学者たちは現在、5,300歳の氷子Oetziの胃の中に発見されたH.pyloriが、酸逆流および喘息から保護する可能性があることを認識しています。
マイクロビオームかミクロビオタ？
微生物群集を含む胃腸および免疫疾患の治療に関連する科学的進歩のために、最近、マイクロバイオームおよび微生物叢は、多くの報道機関を受けている。 2つの用語が使用されている方法にはあいまいさがあります。 カリフォルニア大学デービス校のJonathan Eisen博士は、現在、マイクロビオムは、体内の特定の生息地、例えばヒトの腸を占める微生物の集合を指すのに一般的に使用されていることに留意した。 この用語は、1800年代に最初に使用され、産科および婦人科に関する古いイタリアの本に掲載されています。
科学雑誌ネイチャーのような他の信頼できる情報源はまた、微生物を微生物内の遺伝物質として定義している。 彼らの見解では、微生物叢は生物の全コレクションを指す。
用語の使用には多少の矛盾があるように見えるが、科学界はヒトの健康に対する微生物の寄与が重要であることに一義的に同意する。
それにもかかわらず、異なる疾病への直接的な影響と因果関係を研究することは時には困難なことがあります。
人々の間でのマイクロバイオメトリックの移動
2016年、 ネイチャー・メディスン （ Nature Medicine）に 、母親のミクロバイオームを新生児に移すプロセスを記述した研究が掲載されました。
帝王切開によって生まれた赤ちゃんが自己免疫疾患を発症する可能性が高いことが以前から確立されています。 彼らの送達様式は、それらを膣微生物に曝露しないので、誕生直後に、それらの腸内微生物は、それらの母親の皮膚と類似している。 対照的に、膣で生まれた赤ちゃんは、母親の膣微生物に似ている腸内微生物を有しており、これは特定の有害な状態からそれらを保護するようである。 ニューヨーク大学のマリア・ドミンゲス・ベロ准教授が設計した実験では、母親の膣微生物をCセクションで生まれた赤ちゃんに移した。 母親は綿棒をして、赤ちゃんは出産直後に入植した。 1ヵ月後に検査されたとき、膣微生物を接種された新生児にはまだ母親の膣によく似た微生物があった。 「膣の播種」とも呼ばれるCセクションに続く膣内細菌叢のこれらの移動は、将来的に重要な処置となり、自己免疫状態を予防するのに役立つ可能性がある。
しかし、一部の専門家によると、練習はますます人気が高まっているが、そのメリットはまだ実証されていないと警告している。 インペリアルカレッジロンドンのAubrey Cunnington博士は、膣液には赤ちゃんに有害な細菌やウイルスも感染する可能性があると主張しています。 今のところ、医療従事者は一般的に膣の播種を行わないように勧められています。
糞便性微生物移植（FMT）または細菌療法もまた研究されている。 これは、例えば、有益な細菌を破壊する以前の抗生物質治療の結果として、腸内に細菌の不均衡を有する患者に適用されている。
再発性クロストリジウム・ディフィシル （ Clostridium difficile）大腸炎 （抗生物質を服用している人に発生する可能性がある）と診断された人々は、健康な献血者から便を移して治療できるようになりました。 クロストリジウム・ディフィシレ感染症は最も一般的な病院感染であると考えられている。 この感染症はしばしば再発性の下痢を引き起こす。 デンマークの2人の医師Michael Tvede博士とChristian Rask-Madsen博士はC.difficile細菌に関連する下痢の治療に多くの可能性を示す特定のタイプの細菌療法を開発しました。 FMTと同様に、直腸細菌療法（RBT）と呼ばれる方法は、正常な腸内細菌叢を再導入することを目的としている。 RBTを受けた55人の患者を対象とした研究では、患者の80％（胃腸疾患のない患者ではより良い結果）で治療が成功したことが示されました。 TvedeとRask-Madsenは、患者に生菌を接種するときに常にリスクが伴うことを認識しています。例えば、血流感染が発症する可能性があります。 RBTの10日後、患者の1人は、おそらくRBTと関連した急性症状のある病院に入院しました。
ヒューマンガットオンチップ技術
ハーバード大学のチームは人間の腸の制御されたモデルをマイクロエンジニアリングするためにヒューマンガットオンチップ技術を用いて腸内細菌および炎症の研究において重要な進歩を遂げました。 このモデルは、人間の腸の自然な状態を模倣しており、研究者は腸の細菌の増殖や腸炎を研究することができます。 初めて、科学者は、異なる病態生理学的反応およびインビトロで個々の病原体および細胞の寄与を分析することができる。
uBiomeのようなサービスも出現しており、ヒトの細菌の検査を市民の科学に変えています。 しかし、これらの人気のある機関には多くの制限があります。 科学は未だにまだ始まっておらず、腸内の細菌だけを見るだけでは必ずしも腸内環境と腸全体の健康状態を包括的に把握することはできません。
>出典：
> Blaser M、Chen Y、Reibman J.ヘリコバクターピロリは喘息およびアレルギーから保護しますか？ BMJ Gut 。 2008;（5）：561-567
> Cunnington A、Sim K、Deierl A、Kroll J、Brannigan E、Darby J. "膣の播種"帝王切開で生まれた乳児。 BMJ.2016; 352：1-2。
> Dominguez-Bello M、De Jesus-Laboy K、Clemente J、et al。 膣内微生物移動を介した帝王切開児の微生物の部分的修復 自然医学 。 2016;（3）：250-254
> Kim H、Li H、Collins J、Ingber D. ヒトのGut-on-a-ChipにおけるM microbiomeおよび機械的変形の腸内細菌の増殖および炎症への寄与。 アメリカ合衆国国立科学アカデミーの議事録 。 2016; 113（1）：E7-E15
> Maixner F、Krause-Kyora B、Zink A、et al。 アイスマンの5300年前のヘリコバクターピロリゲノム。 科学。 2016; 351（6269）：162-165
> Tvede M、Tinggaard M、Helms M.原著：再発性クロストリジウム・ディフィシル関連下痢に対する直腸細菌療法：デンマーク2000〜2012年の患者55例の結果 臨床微生物学と感染症 。 2015; 21：48-53